本系之課程學分設計以符合醫務管理基本專業能力，以及醫療產業管理組及健康管理組二系組之培育重點與核心能力為原則。日四技畢業總學分數為128學分，其中必修學分為79學分，包含校共同必修、系共同專業必修及學群專業必修課程；選修學分為49學分，包含系進階選修、系組選修及跨系選修等。

    除了透過系共同專業必修課程培養學生醫務管理基礎知識及技能及系組核心能力之外，為了達到系組個別的培育重點目標，本系依據二個系組之培育重點與核心能力擬定系組專業必選修課程10學分。

• 醫療產業管理組：希望強化學生具備醫療產業分析及因應能力，並擁有醫院專案規劃及病歷資訊管理之知識與技能，故系組專業必選修課程包括：大數據分析概論、醫院規劃與設計、醫療經濟學、保險申報實務及整合性健康照護等5個科目。
• 健康管理組：希望培育學生具備衛生行政及預防保健之觀念，並具備各場域之健康促進與健康管理專業知識和技能，其專業必選修課程則為心理學、營養學概論、芳香療法、生死學及健檢管理與實務等5個科目。