日間部四技之教育目標為：「培養具備醫務行政、病歷暨醫療資訊管理及健康管理理論與實務的專業，並擁有醫學、語言及人文社會素養的醫務管理專業人才」。「醫療產業管理組」強化學生具備醫療產業分析及因應能力，並擁有醫院專案規劃及病歷資訊管理之知識與技能。「健康管理組」則培育學生具備衛生行政及預防保健之觀念，並具備各場域之健康促進與健康管理專業知識和技能。

碩士班之教育目標為：「培養具備決策分析、解決問題、實務管理與研究之能力，成為醫療機構管理、健康照護管理與健康產業管理理論與實務兼備之中高階管理人才」；碩士在職專班之教育目標為：「培養產業界在職人員增進醫務管理相關專業知識及專案研究能力，成為醫療機構管理、健康照護管理與健康產業管理理論與實務兼備之中高階管理人才」。